巴氏杀菌流水线的工作是温度控制仪将设定的pu值（是巴士杀菌单位，在60°下经历1分钟所引起的灭菌效应为一个巴氏杀菌单位，即一个pu值）转化为各温区水槽的实际控制温度曲线，通过对温度的检测精确控制各温区的温度变化，主传动电机带动上下两层输瓶链网将产品依次经过三个温区的逐级升温预热、两个温区的杀菌和三个温区额逐级降温冷却过程，达到将产品杀菌又冷却至室温以保持风味特性的目的。传动装置的是借助不锈钢链板或网链，将包装好的产品缓慢地传送并穿过隧道进行杀菌处理。
巴氏杀菌流水线运行速度，温度可根据工艺要求进行控制，运行平稳，不锈钢网带强度高，伸缩性小，不易变形，保养简单，解决了灭菌过程中因为自动化程度不高而引发的灭菌不均匀等问题提高了灭菌的效率，该设备可连接清洗风干流水线，使产品可以直接装箱打包。
生产工艺：
将混合原料加热至68～70℃，并保持此温度30min以后急速冷却到4-5℃。因为一般细菌的致死点均为温度68℃与时间30min以下，所以将混合原料经此法处理后，可杀灭其中的致病性细菌和绝大多数非致病性细菌；混合原料加热后突然冷却，急剧的热与冷变化也可以促使细菌的死亡。
巴氏杀菌流水线的优点：
1、每个杀菌系统配用循环泵，通过管道把热水或冷水送到需要杀菌的物品上，被杀菌物品在室内慢慢输送，达到降低杀菌温度的目的。水循环由出料端往进料端循环，使杀菌温度更均衡，循环水泵前边加有过滤系统，以防止槽内杂质抽到泵中，长时间在杀菌（冷却）槽内循环；
2、整机设计合理，运行安全可靠，结构紧凑，占地小，操作容易，维修方便、安装简单；
3、机器运行平稳，无极变频调速，噪音低。不锈钢网带强度高，伸缩性小，不易变形，易保养。该机结构紧凑、操作方便、故障率低，加热方式采用锅炉蒸汽或锅炉热水，特别适合连续漂烫杀青作业。
