制药厂专用臭氧发生器广泛应于制药厂GMP认证、食品企业QS认证、加工车间HACCP、封闭公共场所、生物制品、遗传工程等具有HVAC系统的行业，利用HAVC系统对各洁净区域做定时消毒灭菌和净化，特别适用于防爆和多系统环境。
制药厂专用臭氧发生器在制药厂的主要应用：
1、容器的消毒灭菌
将高浓度的臭氧水直接打入管道容器，保持一定的残余臭氧量，就可以达到消毒灭菌的要求。用臭氧对管道容器做消毒灭菌的优点非常明显，臭氧随生产用水流 动，即可对水体消毒，同时对所经过的各个生产单元及时消毒，使用效率*，很方便所以在制药厂就能够得到推广。
2、利用空调净化系统对洁净区的消毒灭菌
将臭氧发生器直接放在空调净化系统的风道中，称为内置式臭氧发生器。臭氧随着风道的气流，送入各洁净区，对洁净区进行消毒灭菌，剩余臭氧吸入回风口，由空调带走。由于臭氧设备的技术含量低，20世纪90年代末期新生了一大批小型臭氧生产企业。他们与净化公司向制药厂推广廉价的空调净化系统用内置式臭氧设备，由此导致产品指标无法检测、性能降低快等严重问题。因此，目前内置式臭氧发生器已经逐步被淘汰。
将臭氧发生器放在空调风口的外面，将臭氧打入空调的风道中，然后被送入各洁净室，称为外置式臭氧发生器。外置式臭氧发生器安装检修方便，但制造成本要高一点。两种方法消毒效果都是一样的。
外置式臭氧发生器是标准型发生器产品，符合国家相关行业标准要求。该发生器配置气源干燥净化系统、臭氧发生室、冷却系统、电源与控制保护系统等，因此稳定、安全。其臭氧发生量可准确测定。在使用中，可将标准型发生器放在空调机房内，臭氧随输出管被引入主供风道，随供风通入各消毒空间，从而达到特定的消毒效果。发生器的控制系统可以与空调机组连接协调工作，其还可带多个空调机组，利用电磁阀分时控制，各空调机组分时工作。李汉忠主任强调，虽然外置式发生器的价格比内置式要高得多，但其可靠的 性能、稳定的消毒效果和较长的使用寿命，对满足制药过程的杀菌要求是*必要的。
3、 空间的消毒灭菌
对于空调净化系统以外的洁净室，或需要灭菌的其他房间则需单独进行灭菌处理。方法是选用臭氧发生器，直接安装在该房间内。根据需要设定消毒时间， 消毒结束便自动关机，所以使用非常方便。臭氧浓度按设计。按房间空间体积的大小选型使用。只要满足臭氧浓度的要求，就可以达到消毒灭菌的 目的。比用化学试剂对房间的熏蒸要省事得多。
4、 水的消毒灭菌
在制药厂用水的地方较多，有医药用水，消毒用水，清洗用水及饮用水等区别。根据不同的水质要求，采用不同的工艺流程，消毒工艺则用一般的臭氧水处理方法即可达到满意的效果。
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