搅拌式微波胶体杀菌机的微波杀菌时间短、速度快，不需要预热，即开即用，杀菌有效保持营养成份和传统风味，防止霉变，存储时间长，环保、没有污染，杀菌效果好，均匀，操作简便，便于控制，自动化操作，设备简单，工艺，设备占地面积小，节省成本。微波对细菌的热效应是使蛋白质变化，使细菌失去营养，繁殖和生存的条件以水为介质，分杀菌槽、冷却槽两部分，杀菌菌温度、速度可根据物料加工工艺要求设定。例如辣椒粉原料含菌量大概在几十到上百万左右，通过微波杀菌处理后辣椒粉含菌量菌落总数可达到3万左右，物料初始含菌量在10~20万左右，微波杀菌后可达1万以下大肠杆菌、霉菌等。不破坏原有的营养成份、色泽、口感和天然风味。剁辣椒 ≤30 未检出，豆鼓辣椒 ≤30 未检出，辣椒萝卜 ≤30 未检出，蒜蓉辣椒 ≤30 未检出。
搅拌式微波胶体杀菌机是利用了电磁场的热效应和生物效应的共同作用的结果。杀菌有效保持营养成份和传统风味，防止霉变，存储时间长，环保、没有污染，杀菌效果好。微波杀菌与传统的杀菌方式相比，微波杀菌温度一般在70-105就能达到效果。杀菌过后的产品能够长时间的保存，延长其保质期限。微波处理可以取得良好的杀虫效果、物料中昆虫的杀虫效果与物料和虫体的介电性质密切相关，当物料的含水量小于12%时，有利于增强杀虫的效果，使金物料中的霉菌不在生存从而起到防霉作用。微波辐照杀菌使体内蛋白会受到无极性热运动和极性转动两个方面的作用，使其空间结构变化或破坏而使其蛋白质变性。
