金针菇有很强的再生能力，当小菇变干枯萎时，其菌柄上会形成许多新的子实体原基，这些原基通过适当管理可以发育成菇体。采用再生法育出的菇密而齐、菌柄细、不易开伞、产量高。
　  入室催菇　菌筒长满袋后移入栽培室，保持室温在12～15℃催菇。料面子实体长2～3厘米（呈须根状，只长柄，未长盖）时打开袋口，下卷贴近料面，将子实体下压使其倒伏，紧贴并均匀铺满料面。若有少量子实体已长菌盖，可剪去菌盖。
　  加强通风　开袋后加强通气。压倒的菌柄第二天便开始干枯变褐，一般开袋后4天左右干枯的菌柄上会长出大量小白点（子实体原基），气温低于12℃时需5～6天。采用再生法栽培，长出的子实体多，应注意通风换气。在每次盖湿布前通风0．5～1小时，夜间打开窗户通风换气1小时，气温超过15℃时在夜间盖好湿布后通风4～5小时。经这样管理菇质好，产量高。
　  拉直袋口　菌柄直径达2～3毫米时拉直塑料袋口。相对湿度大或菌柄较粗不易干枯，压倒后不分生出小菌蕾，仍能从菌柄上长出菌盖，在这种情况下菇也会比原来长得多而密，菌柄高度也较整齐一致。
　  调节湿度　菌柄长10厘米，空气相对湿度低于85％时，在袋口上盖湿布或在盖纸上勤喷水。菌柄长15厘米、菌盖直径不超过13毫米，达到商品规格时及时采收。采收后去除料面老菌皮和残留菌柄，让料面干燥1～2天，再将袋口加套环和棉塞培养8～15天，这样能出第二批菇。培养料较干，应提前在袋口上盖湿布，一般袋口拉直后就应盖湿布。第二批菇的管理与*批菇相同。