自动装卸笼系统是实现整个后杀菌系统连续高效工作的保障，主要是由自动装笼系统、隔板及笼筐输送、自动卸笼系统组成。本系统主要应用于对PE瓶、玻璃瓶、两片罐、三片罐饮料在杀菌后进行自动装笼、卸笼作业。

  将灌装好的产品由输送线送至装笼机，并自动将产品有序的码放进笼筐中；笼筐输送线自动将满筐产品送入杀菌釜，杀菌好的产品再由笼筐输送线送至卸笼机，并自动将产品从笼筐中取出；取出后的产品由输送线自动送至后包装设备进行检测及包装；节省人力，大大提高工作效率。