高通量植物叶绿素荧光农业检测仪能够获得用于表型分析的可见光成像、用于光合作用分析的叶绿素荧光成像、在近红外区的NIR反射成像R_NIR、反映叶绿素含量的叶绿素指数成像R_Chl，以及反映花青素含量的花青素指数成像R_Ant。PhenoMate包括带成像系统的直角坐标机器人系统、带NAS的控制电脑系统（配备24英寸显示器、键盘、鼠标）、预装分析软件的分析电脑系统（配备24英寸显示器、键盘、鼠标）等。

高通量植物叶绿素荧光农业检测仪的培养桌用于放置植物进行测量及培养，配备直角坐标机器人用于在x-、y-和z-方向上自动移动成像系统。这个培养桌可以放置1056株植物。PhenoMate的成像单元每次可以测量16株植物，而这16株植物都可以进行独立分析。用这种方法只需要移动66个位置就可以完成1056株植物的测量，大大提高了测量效率，做到了高通量植物表型测量。

PhenoMate采用一种潮汐式灌溉水培系统对生长在岩棉（rockwool）介质上的植物进行灌溉和添加营养。岩棉具有很好的透气性和保水性，经过1600℃的高温提炼，无菌、无污染，是欧洲主要的无土栽培基质。采用岩棉种植可以进行精确的水分管理和养分管理，有效地控制根系的生长，实现植株营养生长生长平衡。

PhenoMate的培养系统包括两套灌溉系统，分别位于培养桌的左侧和右侧。每套灌溉系统有独立的储水罐和泵，这样就可以在一个实验中实施两套不同的灌溉和营养方案。每套灌溉系统能够放置528个40 mm x 40 mm x 40 mm的岩棉块，合计放置1056个。

PhenoMate采用LED作为激发光源来激发叶绿素荧光（红色）或进行多光谱测量（白色/近红外），获得叶绿素荧光成像、可见光成像（R/G/B），以及叶绿素、花青素和近红外区的反射光谱。由于采用一个相机和光学镜头来进行所有这些成像的测量，因此所有的成像结果都可以进行逐个像素的比较。图像已非处理16位RAW格式存储。利用配套的控制软件，可以在这个培养桌的任意位置进行测量。

PhenoMate的分析软件提供了配套的成像算法，用于对成像结果进行光合作用、可见光或多光谱的计算分析，数据以CSV格式存储。